Belmopan je spojení dvou slov – „Belize“ podle nejdelší řeky v zemi a „Mopan“ řeky v oblasti, která se vlévá do Belize. První fáze nového města byla dokončena v roce 1970.
V roce 1962 hurikán Hattie zničil přibližně 75 % domů v Belize City. Na základě této události bylo v roce 1962 vybráno jako „nové“ hlavní město Belmopan, které se nachází 82 km od „starého“ hlavního města Belize City. Belize byla britskou kolonií. V roce 1981 získalo Belize nezávislost.